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在卡曼尼亚休整一段时间后，公元前324年初，亚历山大命赫斐斯申率领主力队由路向波斯本土军。他则率领一分轻装步兵、近卫骑兵由陆路先行到达波斯古都帕萨尔加德，拜祭了居鲁士大帝之墓，然后到达波斯帝国首都波斯波利斯，他要在那开始他的亚历山大帝国的治理工作。

亚历山大将队分为陆两分，陆军由他率领，包括15000人的队以及随军的妇女、儿童、学者等，这一路将沿着海岸线行。路由从其顿赶来的海军统帅尼阿丘斯率领，包括150艘舰只，5000名手和一些士兵。这一路的任务不单纯是返航，亚历山大还让他们开辟一条从印度河到两河域的航。

尼阿丘斯所率路，因季风问题，迟于陆路近一个月才发，沿途也历尽艰险，航行了80日后，到达了波斯湾的霍尔木兹海峡。尼阿丘斯带领一些士兵上岸在卡曼尼亚的古拉什凯德找到亚历山大。这样，经过三个多月的艰苦历程，三路大军又会师了，这预示着亚历山大对亚洲将近10年的征战画上了句号。

利亚人虽然最后被征服了，但却几乎搭上了亚历山大的命。三路大军会合后，亚历山大命克拉特拉斯率一分军队，经阿拉科提亚人和扎兰迦亚人的地区，到卡曼尼亚。他自己则率主力队沿印度河航行，到达印度河三角洲地带的帕塔拉地区。印度河在帕塔拉分成两条大河海，亚历山大经考察选择了一条比较平静的大河航行来到印度河的海。在征集了返程必备的给养后，大军踏上返程。

城池发起攻，城池很快被攻破。亚历山大命令将城池夷为平地，又率军向希发西斯河军，渡过此河就可以向恒河域军。在亚历山大看来，恒河是世界上最长的河，它的海是世界的最东方，征服了恒河域也就征服了整个东方。

亚历山大虽然决定班师还朝，但决定从路返回比，他是想通过回程征服一些尚未归顺的沿海落。他将队分成三路：一路由克拉特拉斯率领，沿希达斯斯河右岸行；一路由赫斐斯申率领，沿希达斯斯河左岸行；他自己则率领一分队乘坐1000只船顺希达斯斯河阿西尼斯河，又由阿西尼斯河印度河，由印度河大海。同时，亚历山大命令印度总督菲利普在主力队发三日后率其所属队跟。

公元前326年11月的一日早晨，其顿大军踏上了归程。在返程途中，亚历山大不忘记去征服利亚人。这个落在亚历山大与大士拉米加大战中曾兵协助大士三世作战，亚历山大对利亚人一直耿耿于怀，一直想征服他们。

公元前325年9月，亚历山大所率陆军队发了，这支队先是征服了欧瑞坦人，然后又经过60天的沙漠中的艰苦行军占领迦德罗西亚人的首府。在那经过几天的休息，向卡曼尼亚前，与先期到达的克拉特拉斯一在此会师。

但亚历山大渡过希发西斯河向恒河域的命令却遭到了下的抵制，他们认为经过数年的征战，其顿人占领的地方和掠夺的财富已经够多了，应该享受享受了。经过几日的劝说，亚历山大见士兵们没有回心转意的意思，便让占卜师问了一下神谕，结果神谕显示渡河是凶兆。于是亚历山大顺推舟宣布不再行下一步的征伐，撤回首都比。